Chipola College fue fundado en 1947 y operó durante un año como una institución educativa privada.
La Ley de Fundación Mínima de Florida, aprobada en 1947, incluía disposiciones para el apoyo público de los colegios. Bajo las disposiciones de esta ley, se aprobó un distrito universitario que consistía en los condados de Jackson, Calhoun y Washington para operar como una institución pública con el apoyo financiero de los tres condados y el Estado de Florida. La Junta Estatal de Educación otorgó esta aprobación, y Chipola Junior College se convirtió en una institución pública a partir del 1 de septiembre de 1948.
El distrito original de los condados de Calhoun, Jackson y Washington se amplió más tarde para incluir los condados de Holmes y Liberty.