Chipola College został założony w 1947 roku i przez jeden rok działał jako prywatna instytucja edukacyjna.
Ustawa o minimalnym funduszu Florydy, uchwalona w 1947 roku, zawierała przepisy dotyczące publicznego wsparcia dla uczelni. Zgodnie z postanowieniami tej ustawy, zatwierdzono okręg uczelniany składający się z hrabstw Jackson, Calhoun i Washington, który miał działać jako instytucja publiczna z finansowym wsparciem ze strony trzech hrabstw oraz stanu Floryda. Stanowa Rada Edukacji udzieliła tej zgody, a Chipola Junior College stał się instytucją publiczną z dniem 1 września 1948 roku.
Początkowy okręg hrabstw Calhoun, Jackson i Washington został później rozszerzony o hrabstwa Holmes i Liberty.